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多发性肌炎骨骼肌组织差异基因表达谱分析

Differentially expressed genes identified in the muscle of patients with polymyositis by microarray analysis

摘要:

目的 筛查PM患者骨骼肌组织中差异表达基因.方法 2015年1月至4月获取于中日友好医院风湿免疫科的5例未经治疗PM患者骨骼肌组织、5例无肌肉病变的创伤患者的对照骨骼肌组织样本,提取组织总RNA,采用基因芯片进行基因表达谱分析.差异表达基因进行基因本体论分析和信号通路分析.采用实时定量PCR方法对芯片筛查的差异基因进行验证.组间比较用t检验,芯片数据分析中的多重比较采用Benjamini-Hochberg法校正.结果 基因芯片共筛选出1 905个差异表达基因,其中787个为上调基因,1 118个为下调基因(差异倍数>2,P<0.05).选择其中3个上调基因和3个下调基因进行实时定量PCR验证,结果证实其表达趋势与基因芯片检测结果一致.基因本体论分析和信号通路分析结果显示这些差异基因主要涉及感染、细胞毒作用等生物学过程,且与其他自身免疫病有部分共同的信号通路失调.结论 PM患者骨骼肌组织与健康人相比存在基因表达差异,PM肌肉病变的发生可能是多基因参与、多基因调控导致.

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