三种细菌HPI核心区ybtE基因核苷酸序列及推导氨基酸序列的比较研究
Comparison of ybtE nucleotide sequence and deduced amino-acid sequence from EAEC HPI,Yps HPI and Yen HPI
摘要目的 比较三种肠聚集性大肠埃希菌、小肠结肠炎耶尔森菌和鼠疫耶尔森菌HPI毒力岛核心区ybtE基因的同源性.方法 PCR扩增肠聚集性大肠埃希菌(EAEC)17-2 ybtE基因的完整序列,克隆后测序.用ABIPRISM软件对该ybtE基因序列与已知的鼠疫耶尔森菌HPI的ybtE基因以及小肠结肠炎耶尔森菌HPI的irp5基因进行核苷酸序列和推导氨基酸序列比较.结果 核苷酸序列,EAEC17-2与鼠疫耶尔森菌及小肠结肠炎耶尔森菌之间的同源性分别为99.8%和98.2%,鼠疫耶尔森菌与小肠结肠炎耶尔森菌之间的同源性为98.2%;推导氨基酸序列,EAEC17-2与鼠疫耶尔森菌及小肠结肠炎耶尔森菌之间的同源性分别为99.8%和97.6%,鼠疫耶尔森菌与小肠结肠炎耶尔森菌之间的同源性为97.8%.结论 ybtE基因作为HPI的功能基因高度保守,EAEC中的HPI可能来源于Yps HPI.
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