换一批
换一批利用基因表达芯片探索多发性硬化的关键基因和通路
Exploring key genes and pathways in multiple sclerosis using gene expression chips
摘要目的 以GEO数据库中GSE21942系列芯片数据为分析对象,分析多发性硬化(MS)中的高通量基因表达来获得差异表达的基因,筛选出与多发性硬化相关的关键基因和通路.方法 利用R语言与DAVID、STRING等方法对差异表达的基因进行GO和KEGG富集分析,构建和分析蛋白质-蛋白质相互作用网络.结果 88个基因被鉴定为差异表达的基因,其中76个基因(86.4％)上调,12个基因(13.6％)下调.Pathway通路分析显示,差异表达基因主要与造血细胞谱系、B细胞受体信号通路、破骨细胞分化、氮代谢等有关,进一步分析筛选出ALAS2、CA1、SNCA、HBB、IL8等核心基因,这些基因在血红素生物合成、突触传递、神经退行性疾病、血脑屏障破坏等生物功能中起重要作用.结论 与健康人相比,多发性硬化样本中相关靶基因表达有较大差异,这些数据可能为多发性硬化相关的发病机制和临床治疗提供新思路.
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分类号
R741
栏目名称
基础医学研究
DOI
10.19405/j.cnki.issn1000-1492.2019.07.002
发布时间
2019-08-12
基金项目
国家自然科学基金
广西自然科学基金
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