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基于转录组测序的ATPR诱导NB4细胞分化过程中lncRNA的初步鉴定与分析

Preliminary identification and analysis of lncRNA during differentiation of NB4 cells induced by ATPR based on transcriptome sequencing

摘要目的 为了探究新型维甲酸衍生物4-氨基-2-三氟甲基苯基维甲酸酯(ATPR)诱导人急性早幼粒细胞白血病NB4细胞分化的潜在作用机制.方法 分别用ATPR和全反式维甲酸(ATRA)诱导NB4细胞分化,然后用基因芯片技术对处理后的细胞进行长链非编码RNA(lncRNA)和mRNA表达谱分析.结果 与ATRA组比较,有775个lncRNA和904个mRNA在ATPR组被筛选出,且顺式调控基因分析了一些关键lncRNA的染色体定位.反式分析结果表明相关转录因子能调节lncRNA的表达.结论 lncRNA在ATPR诱导NB4细胞分化过程中起到重要的调节作用.

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作者 冯钰斌 [1] 胡爽 [2] 李兰兰 [2] 徐小玲 [2] 张梅菊 [2] 彭晓清 [2] 陈飞虎 [2] 学术成果认领
作者单位 安徽医科大学药学院,合肥 230032;中国科学技术大学第一附属医院药剂科,合肥 230031 [1] 安徽医科大学药学院,合肥 230032 [2]
分类号 R737.9
栏目名称 基础医学研究
DOI 10.19405/j.cnki.issn1000-1492.2021.06.015
发布时间 2021-08-09
基金项目
安徽省科技重大专项项目 安徽省高校自然科学研究项目
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