换一批
换一批免疫沉淀联合质谱筛选与纳尔逊湾正呼肠孤病毒σNS互作的宿主RBPs
Screening of host RBPs interacting with Nelson Bay reovirus σ NS by immunoprecipitation combined with mass spectrometry
摘要目的 筛选出宿主细胞中与纳尔逊湾呼肠孤病毒(NBV)非结构蛋白σNS互作的RNA结合蛋白并分析其生物信息学功能.方法 本研究通过构建NBV σNS真核表达载体pEF-HA-MB-S3,验证正确后转染HEK293T细胞,所得的细胞蛋白裂解液经RNase A处理后,利用免疫沉淀富集σNS结合蛋白,经LC-MS/MS质谱分析技术鉴定分析互作蛋白,并且借助相关生信工具挖掘蛋白性质和具体功能.结果 本实验成功筛选出32个与NBV σNS蛋白存在互作的候选RNA结合蛋白;生物分析结果显示,这些蛋白主要定位于细胞质与细胞核中,并且主要参与细胞代谢、生物调控、病毒翻译与转录等生物学过程.结论 本研究初步分析与NBVσNS互作的RNA结合蛋白功能,为深入研究σNS蛋白在NBV生命周期中的作用机制奠定基础.
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关键词
纳尔逊湾病毒σNS蛋白RNA结合蛋白宿主蛋白免疫沉淀nelson nay orthoreovirusesRNA binding proteinsσNS proteininteraction proteinimmunoprecipita-tion
分类号
R373
栏目名称
基础医学研究
DOI
10.19405/j.cnki.issn1000-1492.2023.09.018
发布时间
2023-10-16
基金项目
辽宁省自然科学基金
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