换一批
换一批摘要目的 基于生物信息学筛选糖尿病肾病(DKD)核心基因,探究DKD的治疗靶点,讨论其可能的调控机制.方法 提取GEO数据库(GSE30528,GSE47183)DKD患者肾小球转录组表达数据矩阵,采用生物信息学方法对差异表达基因(DEGs)进行筛选,鉴定出核心差异基因,对核心差异基因进行基因表达与富集分析(GSEA),预测有效靶点.结果 通过对DKD mRNA表达矩阵的筛选和鉴定,共筛选出 5 个核心基因,其中C1orf21、NPHS1 表达显著下调,CD48、COL1A2、TGFBI表达上调,研究得知,NPHS1、CD48 与免疫差异、细胞间交流及细胞表面相互作用等有显著相关性.通过受试者工作特征曲线(ROC)分析、GSEA分析及药物靶点与miRNA预测显示,这些差异基因可能对DKD的治疗具有重要意义.结论 该研究筛选的核心基因与DKD具有显著相关性,有可能作为糖尿病治疗有效标志物,为DKD的治疗与鉴定提供理论依据.
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关键词
糖尿病肾病GEO数据库转录组生物信息学基因筛选药物靶点diabetic kidney diseaseGEO databasetranscriptomebioinformaticsgenetic screeningdrug target
分类号
R341.2
栏目名称
基础医学研究
DOI
10.19405/j.cnki.issn1000-1492.2024.04.009
发布时间
2024-06-20
基金项目
国家自然科学基金
山东省医药卫生科技发展计划项目
烟台市科技创新发展计划基础研究类项目
滨州医学院科研启动基金
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