Cuproptosis基因和特征基因预测急性髓系白血病预后、免疫和肿瘤微环境的价值

Value of Cuproptosis genes and characteristic genes in predicting prognosis,immunity and tumor microenvironment in acute myeloid leukemia

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摘要目的筛选急性髓系白血病(AML)中的差异预后Cuproptosis基因和特征基因并探索其在AML中的预后情况以及在免疫和肿瘤微环境中的生物学作用和相关性.方法利用从TCGA、GEO和UCSC 3个主要数据库下载的AML临床、转录组、基因组和拷贝数数据,并从已发表的研究中收集Cuproptosis基因,从多组学的角度,通过各种生物信息学方法、Meta分析和二次分型,研究Cuproptosis基因和特征基因在生存、免疫、肿瘤微环境、干细胞相关性和药物敏感性等方面作用.结果 1个Cuproptosis基因被鉴定为AML的差异预后基因和5个通过影响Cuproptosis进而影响AML患者预后的特征基因,并建立了预后模型.差异基因主要富集于线粒体活性、氧化还原酶和能量代谢.在免疫方面,巨噬细胞MO、中性粒细胞、活化记忆CD4 T细胞和Tregs与风险评分呈正相关,巨噬细胞M2、静息肥大细胞、辅助滤泡T细胞和记忆B细胞与风险评分呈负相关;在肿瘤微环境方面,低危组的免疫细胞评分低于高危组,并且在总评分中,低危组的肿瘤微环境得分同样低于高危组,说明高危组的肿瘤纯度低于低危组;然而,干细胞在高风险和低风险组之间没有显著相关性,共有14种药物对治疗AML敏感.结论通过构建AML预后模型,显示AML中的差异预后Cuproptosis基因和特征基因与免疫和肿瘤微环境密切相关.