换一批精神分裂症病人外周血差异表达miRNA-181b的生物信息学分析
Bioinformatics analysis of the differential expression of miRNA-181 b in peripheral blood of schizophrenic patients
摘要目的:对精神分裂症病人外周血中差异表达的miRNA-181b进行靶基因、转录因子和信号通路的分析.方法:采用DIANA-TarBase数据库分析miRNA-181b靶基因,应用DIANA-miPath V.3软件对miRNA-181b的靶基因进行GO功能富集分析和KEGG信号通路富集分析,运用DIANA-miRGen v3.0数据库分析miRNA-181b的转录因子.结果:miRNA-181b靶基因共1344个,其中显著表达的共有靶基因是ARHGAP11A、PPA1、YY1和ZC3H12B;miRNA-181b的靶基因广泛参与生物学过程的调节,包括分子功能、RNA结合、细胞组成等过程;KEGG生物信息学分析发现miRNA-181b的靶基因富集了12条信号通路,包括hippo信号通路、p53信号通路、HIF-1信号通路、赖氨酸的降解等;与miRNA-181b显著关联的转录因子有7个,其中JUN、EGR1、MEF2C与精神分裂症有显著关联.结论:对精神分裂症病人外周血中差异表达的miRNA-181b进行生物信息学分析,发现了多个靶基因、信号通路和转录因子与精神分裂症的发病有密切关联.
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医学主题词
精神分裂症(Schizophrenia)计算生物学(Computational Biology)基因(Genes)病人(Patients)转录因子(Transcription Factors)
分类号
R749.3（精神病学）
栏目名称
DOI
10.13898/j.cnki.issn.1000-2200.2019.02.010
发布时间
2019-04-10（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
基金项目
蚌埠医学院自然科学研究重点项目（BYKY1616ZD）
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