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潜水人群铜绿假单胞菌基因多位点序列遗传分型

Multilocus sequence typing scheme of Pseudomonas aeruginosa isolates from naval divers

摘要目的 研究海军潜水人群铜绿假单胞菌分离株的遗传基因型,明确海军潜水人群铜绿假单胞菌携带株的流行特征.方法 用多位点序列分型(multilocus sequence typing,MLST)技术、以铜绿假单胞菌7个管家基因acsA、aroE、guaA、mutL、nuoD、ppsA和trpE内部特定核酸片段作检测靶,对随机抽样海军潜水员携带的64株铜绿假单胞菌进行目的基因扩增和测序,应用Pseudomonas aeruginosa MLST数据库对测序结果进行分析,以获得检测靶基因的多位点序列信息;应用Bionumerics 4.0的LIAN,SplitsTree和eBURST分析程序对获得的MLST进行进一步的生物信息学分析,以获得流行株的遗传特征.结果 64株铜绿假单胞菌中53株可分为19个ST型,11株未能分型;其中ST274和ST260是优势克隆株,分别占18.75%(12/64)、15.62% (10/64).结论 海军潜水人群携带的铜绿假单胞菌具有遗传多样性和优势基因型,MLST分型对于研究海军潜水人群携带的铜绿假单胞菌遗传差异与流行特征具有重要意义.

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作者 陈双红 [1] 陈锐勇 [1] 陈海庭 [1] 徐雄利 [1] 李慈 [1] 学术成果认领
作者单位 海军医学研究所舰艇卫生研究室,高气压与潜水生理学全军重点实验室,上海 200433 [1]
栏目名称
DOI 10.3724/SP.J.1008.2012.01241
发布时间 2013-02-22(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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第二军医大学学报

第二军医大学学报

2012年33卷11期

1241-1244页

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