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钙调蛋白构象变化路径

Conformational transition pathway of calmodulin

摘要根据已发现的钙调蛋白(CaM)打开和闭合两种不同的构象,研究了拮抗剂对构象变化的影响以及CaM全局构象变化路径.首先,进行了含拮抗剂和不合拮抗剂的两种常规分子动力学模拟,结果表明:CaM在独立存在时具有从闭合状态开启的趋势,它的构象动态变化推动了CaM变构功能的实现;拮抗剂具有将CaM的构象变化"锁住"在闭合状态的功能,有利于CaM控制一些激酶和磷酸酶的活性.在此基础上,进一步用靶向分子动力学模拟了CaM从闭合到打开的构象变化过程,得到一条稳定的变化路径和4个可能的过渡态构象.

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作者 杨坤 [1] 张健 [2] 蒋华良 [2] 朱维良 [2] 王希诚 [1] 学术成果认领
作者单位 大连理工大学,工业装备结构分析国家重点实验室,辽宁,大连,116024 [1] 中科院上海药物研究所,新药研究国家重点实验室,上海,201203 [2]
发布时间 2010-03-26(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
基金项目
国家自然科学基金(10772042)
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