基于肿瘤基因组图谱分析肾透明细胞癌浸润性免疫细胞分布及预后

Analysis of tumor infiltrating immune cell distribution and prognosis of clear cell renal cell carcinoma based on tumor genomic profiling

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摘要目的了解肾透明细胞癌不同分子亚型中浸润性免疫细胞的分布特点,探讨肾透明细胞癌分子亚型与肿瘤预后的关系.方法采用生物信息学方法,对肿瘤基因组图谱(the cancer genome atlas,TCGA)数据库中肾透明细胞癌样本基因表达定量数据进行分析,对获得的肾透明细胞癌分子亚型,应用CIBERSORT软件计算每个肿瘤样本中22种免疫细胞的分布比例,Cox回归模型评估不同肾透明细胞癌分子亚型与总生存期(OS)的关系.结果验证肾透明细胞癌存在3种亚型.533例肾透明细胞癌肿瘤组织中,M2巨噬细胞(28.33％)、未活化CD4+记忆性T胞(18.05％)、CD8 T细胞(l0.05％)、M1巨噬细胞(6.91％)、单核细胞(4.14％)、未活化的肥大细胞(3.86％)、调节性T细胞(3.01％)、滤泡辅助性T细胞(2.83％)及未活化的自然杀伤细胞(2.67％)分布较为丰富.肾透明细胞癌亚型2(4.26％)与亚型3(3.97％)中的调节性T细胞分布比例均显著高于亚型1(1.92％);亚型2(5.79％)与亚型3(5.88％)中的M1巨噬细胞分布比例显著低于亚型1(8.16％);亚型1中的未活化肥大细胞分布比例(5.48％)显著高于亚型2(2.48％)与亚型3(3.45％),以上差异均有统计学意义(均P＜ 0.001).Kaplan-Meier生存曲线及COX回归分析均发现亚型1组患者总生存期相对较长,且预后相对较好;亚型2组患者总生存期最短,且预后也较差;亚型3组患者总生存期介于亚型1组与亚型2组之间.结论不同肾透明细胞癌分子亚型中,浸润性免疫细胞分布比例差异显著,肾透明细胞癌分子分型与患者预后明显相关.