换一批白菜CesA基因家族鉴定及表达模式分析
Identification and expression analysis of CesA gene family in Brassica rapa var. glabra
摘要为探究CesA基因家族在白菜生长发育及纤维素合成过程中的作用机制,该文通过生物信息学的方法,以白菜的全基因组序列为研究区域,进行理化特征、基因结构、进化特征、保守基序及结构域、顺式作用元件和组织表达等鉴定分析.结果表明:(1)共鉴定出16个编码纤维素合成酶亚基的CesA基因,该家族成员所编码蛋白的理论等电点为4.76～9.12,相对分子量为17.76～122.67 kD,长度为153～1089 aa.(2)15个基因不均匀地分布于白菜的7条染色体上,Bra036008定位于scaffold上.(3)大部分成员包含4～14个外显子,1～11个保守基序.(4)该家族具有保守的DDD-QXXRW保守功能域.(5)该家族编码蛋白主要分布在质膜上,二级结构以无规则卷曲与α-螺旋为主,多数成员都含有CesA蛋白典型的N端、C端和跨膜区.(6)CesA基因在茎中表达量相对较高,其中Bra011865、Bra023952和Bra029874在茎、叶、花中显著表达.该研究结果为后续深入研究CesA基因功能以及白菜生长发育研究奠定了基础.
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分类号
Q943.2（植物细胞遗传学）
栏目名称
DOI
10.11931/guihaia.gxzw202107004
发布时间
2023-02-13（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
基金项目
山东省自然科学基金重点项目（ZR2020KC017）
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