换一批基于SmartChip HT-qPCR分析不同食品中抗生素抗性基因的多样性及丰度
Diversity and Abundance of Antibiotic Resistance Genes in Various Types of Food Using SmartChip HT-qPCR
摘要抗生素抗性基因(Antibiotics Resistance Genes,ARGs)广泛存在于各种环境中,被认为是一种新型环境污染物,对环境及人类健康具有潜在威胁.但是目前对于不同食品中多种 ARGs 赋存状况的研究仍然有限.该研究采用 SmartChip 高通量实时定量PCR方法(High-Throughput Quantitative Real-Time PCR,HT-qPCR)对水产品、发酵食品、肉类、蔬菜四大类样品中的ARGs及可移动遗传元件(Mobile Genetic Elements,MGEs)进行了定量分析.结果显示,被分析的15个样品中共检出9个ARGs大类,涉及234个ARGs亚类.所有样品中共有的ARGs亚类为79个,特有的为51个;水产品和肉类样品富集多种ARGs,这些基因表现出较高的丰度(最高可达 3.6 copies/16S rRNA gene).MGEs 的检出数量达 10 个,其中所有样均检出整合子基因intI-1(clinic)和转座酶基因tnpA-01.ARGs抵抗机制分析结果表明,抗生素灭活机制、外排泵机制和细胞保护机制为主要的ARGs抵抗机制,抵抗机制贡献大小依次为:抗生素灭活机制>外排泵机制>细胞保护机制.该研究进一步丰富了对不同食品中ARGs赋存情况的认识,可为食品中ARGs的风险分析提供依据.
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关键词
食品高通量实时定量PCR抗生素抗性基因可移动遗传元件多样性和丰度foodhigh-throughput qPCRantibiotics resistance genesmobile genetic elementsdiversity and abundance
栏目名称
DOI
10.13982/j.mfst.1673-9078.2023.8.1208
发布时间
2023-09-15（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
基金项目
中山市社会公益重大专项（2019B2012）
中山市社会公益重大专项（2020B2010）
广东省自然科学基金面上项目（2020A1515011308）
广东省自然科学基金面上项目（2022A1515012158）
广东省教学质量与教学改革工程建设项目（SJD202001）
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