换一批基于GEO数据库和网络药理学探讨鸡血藤-络石藤治疗强直性脊柱炎的作用机制
Study onmechanism of action of spatholobi caulis-Chinese starjasmine stem in treatment of ankylosing spondylitis based on GEO database and network pharmacology
摘要目的 联合GEO数据库和网络药理学探讨鸡血藤-络石藤治疗强直性脊柱炎(ankylosing spondylitis,AS)的作用机制.方法 采用TCMSP筛选出鸡血藤-络石藤的中药有效成分.检索DrugBank、GeneCards及DisGeNET数据库中关于AS的疾病靶点.从Gene Expression Omnibus(GEO)数据库筛选得到GSE25101 的芯片数据集,并借助R软件4.2.2 进行差异基因分析后,汇总至AS疾病基因靶点.利用Cytoscape 3.9.1 软件构建"中药-有效成分-靶点"网络图,并通过String平台构建蛋白质相互作用网络,筛选得到核心靶点.利用DAVID数据库对交集基因进行富集分析.运用AutoDock Vina 软件进行分子对接.结果 本研究共筛选得到鸡血藤-络石藤治疗AS的靶点50 个,有效成分31 个,涉及IL17、TNF、炎症性肠病等多条信号通路.分子对接结果显示,木犀草素、刺芒柄花素等主要成分与CAT、MMP9、TNF、IL6 等核心靶点有较好的结合潜力.结论 鸡血藤-络石藤可能通过调控炎症反应等基因进而发挥治疗AS的作用.
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