衣壳蛋白和甲基转移酶对戊型肝炎病毒的基因分型
Capsid protein and methyltransferase can be used for genotyping of hepatitis E virus
摘要目的 探讨人戊型肝炎病毒(HEV )的部分编码区序列能否作为其基因组分型的依据.方法 从GenBank中查找并下载全基因组测序完整的能感染人类的 HEV基因组及蛋白序列共35株 ,用Clustal W程序对35株HEV全序列以及部分编码区序列进行多序列比对 ,并用treev 32绘制基因进化树 ,研究其进化关系.结果HEV的基因组全长7 .5 kb ;而衣壳蛋白和甲基转移酶的编码序列分别为1 982 bp和545 bp ,这2种蛋白的多序列比对和进化分析结果与完整基因组的分型结果相符.结论 衣壳蛋白和甲基转移酶可作为 HEV的分型依据 ,且是一种更简便、快捷的方法.
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