换一批小单孢菌(Micromonospora wenchangensis DSM 45709)全基因组测序及分析
Whole-genome Sequencing and Analysis of Micromonospora wenchangensis DSM 45709
摘要小单孢菌(Micromonospora wenchangensis) DSM45709是一种高GC含量的革兰氏阳性放线菌,分离自中国海南文昌红树林沉积物.目前,还没有相关研究报道Micromonospora wenchangensis的全基因组序列,这限制了其代谢产物合成途径和比较基因组学的研究.本研究通过高通量测序技术对小单孢菌DSM45709进行全基因组测序,使用Velvet软件进行组装拼接得到150个Contigs,整个基因组大小约7.51 Mb,GC含量为73.04％,序列已提交至给GenBank数据库,登录号为MZMV00000000.本研究同时对基因组序列进行了基因预测与功能注释、COG和GO聚类分析及次级代谢产物合成基因簇预测等,相关研究结果将为小单孢菌Micromonospora wenchangensis的功能基因组学研究提供基础数据.
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DOI
10.13417/j.gab.037.002409
发布时间
2018-09-13（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
基金项目
国家自然科学基金（31460021）
江西省自然科学基金（20151BAB204003）
江西省自然科学基金（20151BAB204002）
江西省教育厅科研项目（GJJ14250）
江西师范大学研究生创新基金（YJS2015042）
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