换一批思茅松毛虫不同发育阶段的转录组差异分析
Transcriptomic Analysis of Dendrolimus kikuchii at Different Developmental Stages
摘要思茅松毛虫Dendrolimus kikuchii是我国南方针叶林的重大害虫之一,本研究利用DNBSEQ-T7测序平台分别对其卵、幼虫(1龄、4龄、7龄)、蛹、成虫等发育阶段进行转录组测序,并对转录组数据进行参考基因组比对、差异比较和功能富集分析.测序共获得高质量有效读序368027762条.通过比较转录组分析,不同发育阶段共有表达基因9251个,特有表达基因798个,呈现不同的基因表达模式和高表达基因簇;各阶段基因表达差异显著,其中卵与1龄幼虫间的最多,达3336个(上调1902个,下调1434个).通过GO和KEGG分析,差异表达基因主要富集于氧化还原过程、催化活性、跨膜运输、蛋白质水解、几丁质结合及胞外区域等功能,参与细胞周期、细胞外基质受体互作、碳水化合物代谢、蛋白质代谢、能量代谢、解毒代谢及与飞行有关的昼夜节律等通路.本研究为解析思茅松毛虫等全变态昆虫各发育阶段表征提供转录组数据,为后续深入挖掘生长发育相关功能基因及其表达调控和害虫防治策略研究奠定理论基础.
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