换一批Her2(+)/Her2(-)乳腺癌差异表达microRNAs的生物信息学分析
Bioinformatics-based analysis for differently expressed microRNAs between Her ( + )/Her ( - ) breast cancers
摘要目的 通过文献挖掘与生物信息学分析的方法,探讨Her2(+)/Her2(-)乳腺癌之间差异表达的microRNAs可能涉及的生物学功能和信号通路.方法 在NCBI数据库的GEO子数据库及EBI数据库中的ArrayExpress子数据库开展检索,使用关键词“breast cancer”、“microRNA”进行检索,获取Her2(+ )/Her2(-)乳腺癌之间差异表达microRNAs.利用microRNAs靶基因预测软件预测所有差异表达microRNAs的靶基因,进行通路分析.结果 找到2个在Her2表型不同的乳腺癌中差异表达的microRNAs数据集,利用软件TargetScan预测差异表达microRNAs的靶向基因,取其合集进行富集分析,最后将富集得到的基因利用David数据库进行分析,从而得到了上述差异表达的microRNAs可能具有的生物学功能和参与的调节通路.结论 差异表达的microRNAs通过调节靶向基因参与不同信号通路,实现多种生物学功能.
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分类号
R737.9（泌尿生殖器肿瘤）
栏目名称
DOI
10.3969/j.issn.1002-266X.2012.33.002
发布时间
2012-11-29（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
基金项目
卫生部科技专项基金（(W2009BX015)）
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