医学文献 >>
  • 检索发现
  • 增强检索
知识库 >>
  • 临床诊疗知识库
  • 中医药知识库
评价分析 >>
  • 机构
  • 作者
默认
×
热搜词:
换一批
论文 期刊
取消
高级检索

检索历史 清除

基于生物信息分析学方法筛选多发性骨髓瘤差异表达基因

Screening differentially expressed genes in multiple myeloma based on bioinformatic analysis

摘要目的 基于生物信息学筛选多发性骨髓瘤(MM)的差异表达基因,并分析差异表达基因的生物学功能及其调控通路.方法 从GEO数据库中下载基因芯片数据GSE113295,应用GEO2R在线分析工具基于R语言的limma包分析基因的表达数据,以P<0.05、|logFC|>1.5为条件筛选出MM样本中的差异表达基因(DEGs),运用DAVID数据库在线分析工具(https://david.ncifcrf.gov)对DEGs进行基因本体(GO)分析和基因功能百科全书(KEGG)通路富集分析,利用STRING在线分析工具(https://string-db.org/)和Cytoscape软件构建差异基因所调控的蛋白相互作用网络,基于cytoHubba插件挖掘在生物学过程中发挥至关重要作用的关键基因.结果 本研究共获得1380个DEGs,其GO功能在生物学层面上主要介导免疫反应、细胞通讯、细胞黏附、信号转导过程;在细胞组分层面上主要参与细胞质膜组成、整合及胞外间隙的调控;在分子功能层面主要富集于G蛋白偶联受体活性、细胞黏附分子活性、结构因子活性、细胞因子活性.KEGG信号通路分析显示,差异表达基因主要调控神经活性配体—受体相互作用、细胞黏附分子(CAMs)、过氧化物酶体增殖物激活受体(PPAR)信号通路.在差异表达基因调控的复杂的蛋白互作网络(PPI)中筛选出7个关键基因BUB1B、PPARG、MAPK14、FYN、IL6、ITPKB、ZH2.结论 MM样本的差异表达基因有1380个,其中BUB1B、PPARG、MAPK14、FYN、IL6、ITPKB、ZH2可能参与MM的发生发展,主要调控免疫反应、细胞黏附、细胞质膜组成和整合等生物学过程,可通过神经活性配体—受体相互作用、CAMs、PPAR信号通路进一步探索MM的发病机制,为进一步探索MM的治疗靶点和预后标志物提供理论依据.

更多
广告
栏目名称
DOI 10.3969/j.issn.1002-266X.2019.15.007
发布时间 2019-07-17(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
  • 浏览174
  • 下载261
山东医药

山东医药

ISTICCA

加载中!

相似文献

  • 中文期刊
  • 外文期刊
  • 学位论文
  • 会议论文

加载中!

加载中!

加载中!

加载中!

法律状态公告日 法律状态 法律状态信息

特别提示:本网站仅提供医学学术资源服务,不销售任何药品和器械,有关药品和器械的销售信息,请查阅其他网站。

  • 客服热线:4000-115-888 转3 (周一至周五:8:00至17:00)

  • |
  • 客服邮箱:yiyao@wanfangdata.com.cn

  • 违法和不良信息举报电话:4000-115-888,举报邮箱:problem@wanfangdata.com.cn,举报专区

官方微信
万方医学小程序
new医文AI 翻译 充值 订阅 收藏 移动端

官方微信

万方医学小程序

使用
帮助
Alternate Text
调查问卷