结合平板计数与宏基因组学研究方法分析气调保鲜卤鸭掌中微生物污染
Analysis of microbial contamination in modified atmosphere preservation bittern duck feet based on aerobit plate count and metagenomics
摘要目的 研究气调保鲜卤鸭掌中微生物污染的菌相组成及主要致病菌、致病基因与耐药基因的相关情况.方法 从市场采购气调保鲜鸭掌样品,提取DNA,检测DNA浓度,测序、注释,菌种鉴定与丰度分析等,并检验菌落总数.结果 菌落总数结果为 1200 CFU/g,符合食品安全国家标准要求,DNA浓度为 6.54 ng/μL,存在一定程度微生物污染;采用宏基因组研究方法分析菌相组成,共测出 48 种微生物,诺卡氏菌丰度最高,约 75.7%,大肠杆菌、不动杆菌、慢生根瘤菌、盐单胞菌、克雷伯菌、沙门氏菌、弧菌丰度大于 1%;比对SEED数据库,检出对稳态铜的抗性基因;比对KEGG数据库,发现13种代谢通路可感染宿主;比对ARBD数据库,发现 4 个多重耐药性基因,1 个氯霉素抗性基因.结论 宏基因组结合传统微生物研究方法可有效分析样品中微生物状况,并能从分子层面研究致病因子,以及耐药基因的传播机理,对于微生物污染防控,耐药基因传播阻断机制,有重要的借鉴性意义.
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