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背角无齿蚌基因组(GT)n微卫星DNA特征

Characterization of (GT)n microsatellite in Anodonta woodiana genome

摘要利用磁珠富集法筛选背角无齿蚌(Anodonta woodiana)的微卫星分子标记,采用Sau3A1酶对完整DNA进行酶切,以生物素标记的(GT)15寡核苷酸探针从酶切片段中筛选微卫星序列.洗脱的杂交片段克隆到PGEM-T载体上构建富集微卫星基因组文库后,通过菌液PCR筛选检测出阳性克隆进行测序.结果表明:在筛选的180个阳性菌落中,得到37条非冗余序列包含有重复次数不少于5次的微卫星位点,富集效率为20.6%,核心重复序列主要为两碱基重复,占所有微卫星序列的86.4%,其中完美型占32.0%,非完美型占10.0%,复合型占8.0%,非完美与复合型共存的占50.0%;其中完美类型微卫星最大的重复次数为65次;在37条非冗余序列中,共有30条微卫星重复序列两端有侧翼序列能够进行引物设计,经过筛选,11对引物扩增清晰的多态性条带,可用于无齿蚌遗传分析.

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