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从松属相关物种筛选红松微卫星标记及其种群遗传多样性分析

Screening of Pinus koraiensis microsatellite makers from relative species of Pinus and analysis of population genetic diversity

摘要近缘物种筛选法是获取微卫星引物的主要方法之一.利用松属植物EST-SSRs的种间通用性,从马尾松微卫星引物中筛选出红松EST-SSR标记,并与已有的红松基因组SSR标记进行对比分析.采集长白山露水河红松母树林4个种群的248个样本,分析种群遗传多样性.结果表明:马尾松与红松的种间通用率为27.27%,松属内不同亚属物种间的种间通用性偏低;与红松基因组SSRs相比,EST-SSRs的单位点等位基因数(Na)、有效等位基因数(Ne)、观测杂合度(Ho)、期望杂合度(He)等遗传多样性参数均较低;用2组引物分析4个种群的遗传多样性,发现有效等位基因均能反映出不同种群遗传变异的趋势,基因多样性均能反映出遗传同一性的差异,说明两组引物都能准确地反映红松种群的遗传多态性水平,新筛选的EST-SSRs可以用于红松种群遗传多样性研究.

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生态学杂志

生态学杂志

2013年32卷9期

2307-2313页

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