长江上游小眼薄鳅线粒体DNA遗传多样性

Genetic diversity of Leptobotia microphthalma in the upper Yangtze River inferred from mitochondrial DNA

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摘要小眼薄鳅是长江上游特有的小型鱼类,自然分布狭窄.本研究采用线粒体细胞色素b (cytochrome b,cyt b)和控制区序列,对长江上游江津段和岷江下游宜宾段两个群体共108尾小眼薄鳅(Leptobotia microphthalma)样本的遗传多样性和遗传结构进行了分析.结果表明:小眼薄鳅群体cyt b序列共检出28个多态位点,34种单倍型,平均单倍型多样性指数(Hd)和核苷酸多样性指数(Pi)分别为0.889和0.00382;控制区序列共检出变异位点49个,单倍型65种,Hd指数和Pi指数分别为0.958和0.00420.分子方差分析(AMOVA)显示:小眼薄鳅采样点群体内的变异大于群体间的变异,遗传变异绝大部分来自群体内部,群体间无显著遗传分化(FST＜0.05),平均基因流(Nm)表明小眼薄鳅各采样点群体间基因交流十分频繁.基于Network网络结构可将小眼薄鳅样本划分成3个谱系,谱系间显示了显著的遗传分化(FST ＞0.25),提示小眼薄鳅种群内部可能有隔离的产生.核苷酸错配分布及Tajima's D中性检验结果显示小眼薄鳅可能未发生种群扩张事件.