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藻类植物P450nor的生物信息学分析

The bioinformatics analysis of P450 nor from algae

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摘要氧化亚氮 (N2O) 是一种重要温室气体, 细菌、真菌、藻类和高等植物均可释放N2O.细菌通过硝化与反硝化作用产生N2O, 真菌通过关键酶P450nor生成N2O, 但关于藻类和高等植物的N2O产生机制迄今却鲜有报道.本研究以进化地位处于真菌和高等植物中间的藻类为对象, 从Gen Bank中筛选出来自3种藻类 (莱茵衣藻、胸状盘藻和小球藻) 的3条P450nor蛋白相似序列并进行预测和分析, 其功能预测结果显示, 三者均为定位于线粒体中的可溶性非分泌型亲水性蛋白, 具有Pfam P450保守结构域和3个保守motif, 由此推测藻类P450nor具有较高的保守性;其进化分析结果表明, 藻类与真菌P450nor具有较高同源关系.因此, 推测藻类P450nor具有与真菌相似的生物学功能.由于藻类特殊的进化地位, 这将为探究藻类与高等植物的N2O产生机制及全球N2O源汇不平衡提供科学依据和线索.

作者王群 ^[1] 肖璇 ^[2] 邵一伦 ^[3] 孙浩 ^[4] 徐慧 ^[4] 学术成果认领

作者单位 中国科学院沈阳应用生态研究所, 中国科学院污染生态与环境工程重点实验室, 沈阳 110016;中国科学院大学, 北京 100049 ^[1] 沈阳药科大学,沈阳,110016 ^[2] 沈阳工学院,辽宁抚顺,113122 ^[3] 中国科学院沈阳应用生态研究所, 中国科学院污染生态与环境工程重点实验室, 沈阳 110016 ^[4]

关键词 N2O 理化性质保守结构域晶体结构遗传进化关系 N2O physical and chemical properties conserved domain crystal structure genetic evolution

主题词植物(Plants)计算生物学(Computational Biology)真菌(Fungi)晶体(Lens, Crystalline)遗传(Heredity)

DOI 10.13292/j.1000-4890.201808.010

发布时间 2019-08-06（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

基金项目

公益性行业(农业)科研专项（201103039）