基于iTRAQ技术筛选水稻根尖甲基汞胁迫响应差异蛋白及其生物信息学分析

Screening differentially expressed proteins in root tips in response to methylmercury stress by iTRAQ technique and their bioinformatics analysis

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摘要为了解水稻(Oryza sativaL.)对甲基汞胁迫响应的分子机制,采用两优302为实验材料,利用同位素相对标记与绝对定量技术(iTRAQ),联合液相色谱-串联质谱技术(LC-MS/MS),筛选水稻甲基汞胁迫下的根尖蛋白组差异表达蛋白,并结合生物信息学对差异蛋白进行分析.结果表明,对照组与处理组共定量了3508个蛋白质,在差异倍数(foldchange)≥1.20或≤0.83,且P＜0.05条件下,筛选出88个差异蛋白,其中32个蛋白表达上调,56个蛋白表达下调,其中15个差异蛋白(包括类萌发素蛋白和脂氧合酶等12个已知蛋白和3个未知蛋白)具有与金属离子结合相关属性.基因本体(gene ontology,GO)分子功能提示,差异性蛋白主要涉及催化活性、结合和转运活性等生物学过程,京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)通路分析显示,差异蛋白显著富集于内质网蛋白加工、氧化磷酸化、淀粉与蔗糖代谢和苯丙素生物合成等代谢通路.研究结果为今后调控水稻中MeHg的吸收提供依据.