血管紧张素Ⅱ诱导的胸主动脉重构中差异表达基因的筛选及转录因子富集分析
Screening of Differentially Expressed Genes and Enrichment of Transcription Factors in Angiotensin Ⅱ-Induced Thoracic Aortic Remodeling
摘要目的:筛选血管紧张素Ⅱ(Angiotensin Ⅱ,Ang Ⅱ)诱导的胸主动脉重构中差异表达的基因,并进行功能和机制的生物信息学预测.方法:利用GEO数据集(GSE64613)进行差异表达基因的筛选(Fold change≥2,P<0.05).利用在线数据库进行差异表达基因的GO和KEGG通路分析及转录因子富集分析.利用Ang Ⅱ缓释(1 μg/kg/min)的方法诱导小鼠胸主动脉病理性重构.利用实时定量PCR和免疫组织化学检测目标基因和蛋白的表达变化.结果:Ang Ⅱ诱导的主动脉重构共发现325个差异表达的基因,其中表达上调251个,表达下调74个.差异表达基因主要富集在脂质代谢等生物学进程、细胞外区域等成分、蛋白结合等分子功能、PPAR和AMPK等信号通路.Ang Ⅱ缓释4周后,小鼠胸主动脉血管壁明显增厚,弹力纤维明显断裂.实时定量PCR结果证实10个差异表达基因的表达变化与GSE64613数据集结果一致.转录因子富集分析结果显示,PPARG和FOXM1是转录因子协同调节网络的中心枢纽,且在胸主动脉病理性重构中表达明显增加.结论:Ang Ⅱ诱导的胸主动脉重构可能涉及这些差异表达基因及转录因子的调节,可作为高血压相关主动脉疾病防治药物的潜在靶点.
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