心肌梗死患者细胞焦亡相关基因的表达水平及临床意义
Expression Levels and Clinical Significance of Cell Pyroptosis Related Genes in Patients with Myocardial Infarction
摘要目的:探讨心肌梗死患者细胞焦亡相关基因的表达水平及临床意义.方法:从基因表达数据库GEO中下载心肌梗死相关的数据集GSE61144,进行数据预处理后,筛选差异表达基因,通过生物学功能和信号通路富集进行分析,使用STRING数据库和Cytoscape软件构建心肌梗死相关的蛋白质-蛋白质相互作用和中心基因网络,对差异表达基因进行细胞焦亡相关基因的筛选,使用GeneCards数据库对细胞焦亡相关基因与心肌梗死差异表达枢纽基因进行交集.通过ROC曲线进一步分析细胞焦亡相关基因与心肌梗死的鉴别诊断意义.结果:筛选出数据集GSE61144心肌梗死患者中有21个基因表达水平发生显着变化,其中下调基因8个,上调基因13个.基因组百科全书(KEGG)信号通路及基因本体(GO)进行心肌梗死差异表达基因富集分析和功能分类分析显示,这些基因主要涉及与白细胞活化与免疫反应、参与免疫反应的细胞活化、细胞溶解相关的信号通路或生物学功能等.结合数据库GeneCards分析出MMP9、GZMA、LCN2、CAMP为潜在的关键细胞焦亡基因.ROC曲线分析显示心肌梗死患者细胞焦亡相关基因MMP9、GZMA、CAMP对心肌梗死具有良好的诊断价值(P<0.05).结论:细胞焦亡机制参与心肌梗死的病理生理过程,MMP9、GZMA、CAMP的差异表达对心肌梗死具有重要的诊断意义,可能是心肌梗死后细胞焦亡的良好生物标志物.
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