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基于EST和GSS序列的玉米未知微RNA的数据挖掘

Based on EST and GSS Sequences to Predict Maize' s Novel MicroRNAs

摘要miRNAs通过与靶基因互补位点配对结合,在转录后水平负性调控靶基因的表达.根据miRNA进化上的保守性,以拟南芥、水稻等已知的植物miRNAs为探针,与相关数据库中玉米表达序列标签(EST)和基因组序列(GSS)中的非编码序列比对,采用一系列的标准进行筛选,最后预测得到24个玉米miRNA前体,通过靶基因的预测共得到61个靶基因.通过生物信息学方法大大提高了人们发现miRNAs及其靶基因的效率,补充了玉米miRNA数据库的不足.

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分类号 S513
栏目名称
发布时间 2012-03-19(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
基金项目
中央高校基本科研业务费专项资金项目((SwJTU09BR217,SWJTU09ZT28,SWJTU11ZT25))
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生物技术通报

生物技术通报

2011年12期

108-112页

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