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DNA序列数值映射方法的研究

Study of Numerical Mapping Methods for DNA Sequences

摘要DNA序列的数值映射是用数学方法、物理方法和数字信号处理方法分析生物分子序列首先要解决的问题.本文分析了现有8种DNA序列数值映射方法的特点和适应性.在此基础上,提出了一种基于DNA序列中碱基出现概率的数值映射方法.大多数蛋白编码序列具有3 - 碱基周期特性(周期-3性质).借助于具有周期 - 3性质的DNA序列的频谱分析,比较了8种数值映射方法的优劣,并证实了新方法的有效性.计算机仿真结果表明,基于复域的映射方法无论从携带原有生物分子序列的信息量,还是数值映射后所得功率谱的效果均优于其它7种映射方法,而DNA序列新数值映射方法能够获得与复域法几乎相同的识别率.

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DOI 10.3321/j.issn:1001-5515.2005.04.008
发布时间 2005-09-22(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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生物医学工程学杂志

生物医学工程学杂志

2005年22卷4期

681-685页

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