基于TCGA数据库分析FHOD1在结肠腺癌中表达的诊断及预后评估价值
Diagnostic and prognostic evaluation value of FHOD1 expression in colon adenocarcinoma based on TCGA database analysis
摘要目的 基于癌症基因图谱(TCGA)数据库分析Formin家族同源结构域1基因(FHOD1)在结肠腺癌(COAD)组织中的表达水平及其对COAD患者的诊断及预后评估价值.方法 以TCGA数据库为发现数据库(检索时间段为2006年1月1日至2021年2月1日),以基因表达谱数据动态分析(GEPIA)数据库为外部验证的数据库.使用R软件(3.6.3版本)下载TCGA数据库中COAD level 3 HTSeq-FPKM格式的RNAseq数据库并进行基因ID转换,罗列所有患者的FHOD1的表达数据及对应的临床病理资料.绘制散点图进行FHOD1在COAD组织和癌旁正常组织中的差异化表达分析;绘制受试者工作特性曲线研究FHOD1表达对COAD的诊断价值;检索GEPIA数据库并绘制生存曲线,分析FHOD1表达与COAD患者生存时间的关系;采用单因素与多因素Cox回归模型分析临床参数与COAD预后的关系.结果 COAD组织中FHOD1 mRNA的表达量显著高于癌旁正常组织中的表达量(17.76±6.84 vs 11.51±3.27),差异有统计学意义(P<0.05);受试者工作特性曲线分析结果表明,FHOD1对COAD有较好的诊断价值(曲线下面积=0.7835,95%可信区间=0.7307~0.8363,P<0.0001);在分析FHOD1表达与COAD临床病理特征时发现,FHOD1的高表达与COAD的淋巴结转移密切相关(P< 0.05);GEPIA数据库检测了FHOD1与COAD患者的预后关系,结果显示FHOD1的高表达与COAD患者较低的总体生存率(OS)密切相关(P<0.05);单因素分析结果显示M分期、TNM分期是COAD患者OS的独立预后因素(P<0.05);多因素Cox比例回归风险模型结果显示,年龄、TNM分期及FHOD1高表达是COAD患者OS的独立预后因素(P<0.05).结论 FHOD1在COAD组织中高表达,并有潜力成为结肠癌诊断和预后评估的新型生物学标志物.
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