换一批摘要目的 运用生物信息学技术方法,分析影响乳腺癌患者生存的关键基因,为乳腺癌预后评估及靶向治疗提供理论依据.方法 通过TCGA数据库筛选出乳腺癌样本与正常乳腺样本间的差异表达基因,进行基因本体论(GO)和京都基因和基因组数据库(KEGG)富集分析.构建蛋白互作网络并筛选出关键基因.运用Kaplan-Meier法寻找可能作为乳腺癌潜在预后生物标志物的基因并进行验证,探究预后相关靶基因与分子分型及分期的相关性.运用Timer数据库分析预后相关靶基因与免疫细胞浸润相关性.结果 共筛选出差异表达基因1 285个,其中上调基因318个,下调基因967个(|log2FC |≥1,P＜0.05).差异表达基因主要富集于细胞因子-细胞因子受体相互作用、PI3K-Akt信号通路、cAMP信号通路等.蛋白互作网络共筛选出 10 个关键基因(AURKB、CDC20、CCNA2、NCAPG、BUB1、TOP2A、BUB1B、CCNB1、CDK1、KIF11),其中CCNA2、NCAPG、BUB1在乳腺癌组织中表达水平高于正常组织,其高表达与患者总生存期的不良预后相关(P＜0.05),同时与乳腺癌分子分型及分期存在显著相关性.免疫浸润结果显示,CCNA2、NCAPG、BUB1的表达与B淋巴细胞、CD8+T淋巴细胞、中性粒细胞、树突状细胞等免疫细胞的浸润存在显著相关性.结论 CCNA2、NCAPG、BUB1可能是乳腺癌发生发展过程中的关键基因,其高表达与乳腺癌患者预后不良有关,可作为乳腺癌预后的潜在生物标志物.
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关键词
乳腺癌预后分析生物信息学差异表达基因生物标志物Breast cancerPrognostic analysisBioinformaticsDifferentially expressed genesBiomarker
分类号
R737.9（泌尿生殖器肿瘤）
栏目名称
DOI
10.11904/j.issn.1002-3070.2023.05.006
发布时间
2024-03-26（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
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