丙型肝炎病毒非结构蛋白HS5A反式激活基因HS5ATP6的克隆化研究
Cloning and identification of human gene 6 transactivated by nonstructural protein 5A of hepatitis C virus
目的应用抑制性消减杂交(SSH)技术及生物信息学技术(bioinformatics)筛选并克隆丙型肝炎病毒(HCV)非结构蛋白5A(NS5A)反式激活新型靶基因.方法以HCV NS5A表达质粒pcDNA3.1(-)-NS5A转染HepG2细胞,以空载体pcDNA3.1(-)为平行对照,提取mRNA并进行抑制性消减杂交分析.对于所获基因片段序列分析表明,其中之一为新型基因片段,与GenBank中注册的已知功能基因序列没有同源性,利用表达序列标签(EST)序列的搜索和比对,进行电子拼接,根据基因起始密码子的KOZ2ak规则和终止密码子下游保守的多聚腺苷酸信号序列,确定新型基因序列.结果从HepG2细胞提取总RNA,以逆转录多聚酶链反应(RT-PCR)技术扩增获得该新基因的全长序列,并测序证实,命名为NS5ATP6,在GenBank中注册,注册号为AF529367.NS5ATP6基因的编码序列全长为1572个核苷酸(nt),编码产物由524个氨基酸残基(aa)组成.结论HCV NS5A反式激活新型靶基因NS5ATP6的筛选与克隆,为进一步研究HCV NS5A反式激活作用的分子生物学机制和探索新型治疗技术奠定基础.
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