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中国南海沉积环境可培养细菌多样性研究

Diversity of cultivable bacteria isolated from marine sediment environments in South China Sea

摘要[目的]探索海洋沉积环境中可培养细菌的多样性.[方法]采用纯培养分离及16SrRNA基因序列鉴定的方法,对我国南海海域20个沉积物样品进行细菌多样性分析.[结果]共获得200株细菌,分属于47个属,99个种.经系统进化分析,可培养菌株主要分布于4个类群:厚壁菌门(Firmicutes)、变形菌门(Proteobacteria)、放线菌门(Actinobacteria)和拟杆菌门(Bacteroidetes),优势类群为Firmicutes,其中芽孢杆菌属(Bacillus)所占比例为55.6%;而Actinobacteria和Bacteroidetes两个类群获得菌株较少;在Firmicutes和Actinobacteria两个类群中发现8个潜在新种和3个潜在新属级类群.[结论]初步研究结果表明,南海海洋沉积环境可培养微生物资源丰富,新物种资源多样;其中,芽孢杆菌为海洋沉积环境中的优势类群,随着样品深度的增加,细菌多样性呈现递减的趋势,深度可能是影响细菌多样性的一个重要因素;其次,分离培养基和分离方法直接关系到样品中可培养微生物多样性的发现,有待深入研究.

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作者 刘玉娟 [1] 田新朋 [2] 黄小芳 [1] 龙丽娟 [2] 张偲 [2] 学术成果认领
作者单位 中国科学院南海海洋研究所 中国科学院热带海洋生物资源与生态重点实验室 广东广州 510301;中国科学院大学 北京 100049 [1] 中国科学院南海海洋研究所 中国科学院热带海洋生物资源与生态重点实验室 广东广州 510301 [2]
栏目名称
DOI 10.13344/j.microbiol.china.130257
发布时间 2014-05-27(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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微生物学通报

微生物学通报

2014年41卷4期

661-673页

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