摘要[背景]耐盐碱促生细菌对改善盐碱胁迫下的作物生长和提高作物的盐碱耐受能力具有较好效果.[目的]获取兼具耐盐碱和促生功能的微生物资源,深入探究耐盐碱菌的生理生化特性及其耐盐碱分子机理,研究拟从宁夏回族自治区银川市盐碱地土壤中分离获得耐盐碱细菌.[方法]应用形态和显微观察、Biolog Gen Ⅲ微孔板测定和16S rRNA基因序列测定对菌株进行鉴定;利用细菌培养方法进行菌株耐盐碱性和促生效果分析;应用全基因组基因功能注释分析菌株基因组信息.[结果]菌株在pH 8.0-12.0及NaC10％-9％的LB培养基中均可生长,且在pH 8.5-9.5培养环境中降碱率可达到13％以上.菌株碳源利用能力显示菌株可利用54种碳源并对另外20种化学敏感性测试物质敏感.菌株YS-AT2属于柠檬酸杆菌属(Citrobacter),其在盐碱胁迫下对植物的促生效应结果显示:(1)菌株可在pH 9.5且含NaHCO3的盐碱性环境中促进拟南芥野生型种子生长;(2)在50-200 mmol/L NaCl或50-200 mmol/L NaHCO3盐碱胁迫下促大豆种子萌发;(3)在pH 8.2、土壤电导率(electricity conductivity,EC)为450μs/cm 土壤中大豆株高、鲜重、干重和根长可分别提高19.84％、18.75％、10.31％和32.58％.对菌株全基因组基因功能注释分析发现,菌株YS-AT2具有多个与嗜盐和嗜碱密切相关的基因,分析其耐盐碱机制可能是通过自身细胞对盐碱性物质的运输、对钠、钾离子的转运和调节及合成高浓度细胞物质而实现的.[结论]本研究解析了耐盐碱促生菌Citrobacter YS-AT2对拟南芥和大豆的促生效应,挖掘其中耐盐碱相关基因,不仅为开发具有耐盐碱促生功能的生物肥料提供理论依据和菌种资源,还为进一步揭示嗜盐碱细菌的分子机理奠定了理论基础.