胃癌免疫相关LncRNA预后风险模型的建立与分析

Establishment and analysis of the prognostic risk model of gastric cancer immune-related LncRNA

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摘要目的旨在分析免疫相关LncRNA在胃癌中的表达及预后的作用,建立免疫相关LncRNA预后风险模型.方法从TCGA数据中下载443例胃癌样本的转录组数据和临床信息.从GSEA数据中获取免疫基因列表,采用共表达法筛选免疫相关LncRNA.采用单因素Cox回归分析筛选胃癌免疫预后相关LncRNA,纳入多因素Cox回归分析.根据最佳AIC值确定具有独立预后意义的免疫预后相关LncRNA构建预后风险模型,计算每例患者的风险评分,根据中位风险值将患者分为低风险组和高风险组,采用Kaplan-Meier分析法进行生存分析并绘制生存曲线,使用ROC曲线对预后风险模型进行评估,同时单因素和多因素Cox回归分析风险评分和临床病理特征与胃癌患者生存预后的关系.结果从TCGA数据中下载443例胃癌样本转录组数据中共提取到14142个LncRNA的表达谱,546个LncRNA鉴定为免疫相关LncRNA(Cor>0.6,P<0.001),其中9个LncRNA与胃癌预后相关(P<0.01),进一步纳入多因素Cox回归分析,根据最佳AIC值筛选出6个免疫相关LncRNA建立预后风险模型,生存分析显示高风险组患者总生存率明显低于低风险组患者(P<0.01),预后风险模型曲线下面积AUC值为0.708.多因素Cox回归分析显示患者年龄和患者风险评分为胃癌预后的独立危险因素.结论基于6个免疫相关LncRNA构建的预后风险模型为胃癌的独立预后影响因子,可以有效预测胃癌患者的生存预后.