换一批
换一批ABAT基因在肝癌中的表达及功能探讨
Analysis of the expression and function of ABAT in liver cancer based on bioinformatics
摘要目的 基于生物信息学分析ABAT基因在肝癌中的表达及功能探讨.方法 利用在线Oncomine和GEPIA数据库分析ABAT在肝癌与正常肝组织的表达,同时在肝癌细胞株采用qPCR及Western blot法检测ABAT的表达;从NCBI-GEO数据库(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/gds/)下载研究号为GSE14520 的芯片数据,提取其中214 例肝癌组织的基因表达谱及相关临床数据,基于ABAT基因表达的中位值分为高低表达组,分析 2 组与其对应的临床信息相关性及预后情况;TCGA数据库数据进行验证ABAT与肝癌的预后,体外实验初步探讨ABAT对肝癌的影响.结果 ABAT在肝癌组低表达且与AFP、TNM分期、转移相关,其总生存率较高表达组差(P＜0.05).体外实验:ABAT抑制肝癌细胞的增殖、凋亡、迁移及侵袭能力(P＜0.05),调控Wnt/β-catenin信号通路(P＜0.05).结论 ABAT在肝癌患者中呈低表达,参与肝癌的进展,影响细胞的生长增殖、周期、细胞凋亡过程,其机制可能与Wnt/β-catenin信号通路相关.
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