换一批基于基因组SNP和ROH的剑白香猪群体遗传结构解析
Genetic Structure Analysis of Jianbai Xiang Pig Population Based on Genomic SNP and ROH
摘要旨在从分子水平分析剑白香猪的群体结构以及遗传多样性,对剑白香猪的种质资源鉴定和保护提供技术支持.本研究利用Porcine SNP50 BeadChip(Illumina,United States)芯片对138头剑白香猪的全基因组SNP进行扫描,通过对主成分、遗传距离、亲缘关系和公猪血统进行分析,研究剑白香猪的群体结构;通过ROH分析,确定剑白香猪的遗传多样性.结果显示,此剑白香猪群体无明显分层,但大致可以分为3个部分,群体内的遗传距离平均值约为0.273,所有公猪划分为4个血统;剑白香猪群体共检测出2 893个ROHs,平均每个个体约有21个ROHs,平均ROH长度约为7.18 Mb,平均近交系数(FROH)为0.27%,表明剑白香猪近交积累较少.通过多种分析表明,该群体家系数量适中,个别家系公畜数量较少,个体间亲缘关系中等,近交程度较低,群体的遗传多样性较高.本研究在基因组水平分析了剑白香猪的群体遗传结构和遗传多样性,为剑白香猪群体复壮和种业安全措施制定提供了分子依据.
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分类号
S828.2
栏目名称
DOI
10.11843/j.issn.0366-6964.2023.10.011
发布时间
2023-11-07（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
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