摘要为了解猪天然免疫受体NLRC5基因特征,用人类、小鼠等物种NLRC5基因已知片段设计分段扩增的引物,同时运用RACE技术,克隆该序列并进行序列生物信息学分析.基因序列分析表明,克隆得到猪NLRC5基因cDNA全长为6638bp,基因开放阅读框为5538bp,共编码1846个氨基酸.蛋白质预测结果显示,NLRC5编码蛋白质整体表现为亲水性,蛋白质结构域分析结果显示,NLRC5具有典型的NACHT区及20个LRRs.同源性分析表明猪与牛、绵羊、猕猴、人等物种具有较高同源性,达到了80%左右,遗传进化树分析表明与牛和绵羊进化关系最近.进一步组织表达分析表明NLRC5基因除在淋巴结、脾脏等系统免疫器官中具有较高表达量,在肠淋巴结、胃、肺等黏膜器官中也有较高的转录水平.本研究结果说明猪NLRC5基因在长期进化中较为保守,尤其在哺乳动物间具有较高的保守性,在免疫反应中可能扮演着重要的角色.猪NLRC5基因序列的成功克隆为后续NLRC5在机体内免疫系统中的功能研究奠定了理论基础.
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