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被子植物中核糖体失活蛋白基因家族分子进化研究

Molecular Evolutionary Analysis of Ribosome-Inactivating Proteins Gene Family in Angiosperm Plants

摘要利用34种具有全基因组数据的代表植物,通过生物信息分析方法,深入挖掘和分析不同植物类群基因组中RIPs基因家族的成员构成,推测其可能的扩增方式和功能分化,并探讨了该基因家族在植物中的总体进化趋势.采用BLAST和HMMsearch两种检索方法共鉴定出79个RIPs基因家族成员;通过序列比对和系统进化树的构建,发现RIPs在单双子叶中存在双起源,RIPs在两者分化之前就已存在.它们可能为适应复杂的环境而出现在早期陆生植物中,随后在长期进化过程中不断发生谱系的扩张和拷贝丢失,最后通过功能分化在不同植物中保留下来,其在被子植物进化的过程中有物种特异性的重复.

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作者 薛亚杰 [1] 余亚军 [2] 侯佳佳 [1] 程柯 [1] 韩雅彭 [1] 袁红雨 [1] 周思源 [3] 程琳 [1] 学术成果认领
作者单位 信阳师范学院 生命科学学院,河南 信阳,464000 [1] 信阳森林工作站,河南 信阳,464000 [2] 郑州外国语学校,河南 郑州,450000 [3]
栏目名称
DOI 10.3969/j.issn.1003-0972.2018.03.010
发布时间 2018-08-21(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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信阳师范学院学报(自然科学版)

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