基于转录组测序探讨白花蛇舌草-半枝莲提取物抗结直肠癌作用机制
Discussion on Mechanism of Hedyotis Diffusae Herba-Scutellariae Barbatae Herba Extract in Treating Colorectal Cancer Based on Transcriptome Sequencing
摘要目的:基于转录组测序探讨白花蛇舌草-半枝莲(HD-SB)提取物对结直肠癌的作用机制.方法:采用不同浓度(0、0.25、0.5、1、2、4mg/mL)白花蛇舌草(HD)提取物、半枝莲(SB)提取物、HD-SB提取物处理3种不同结直肠癌细胞系(HT-29、HCT-116、SW620)24 h,采用CCK8检测细胞活力.选择未处理的SW620细胞(对照组)和1 mg/mL HD-SB处理24 h的SW620细胞(HD-SB组)进行转录组测序,实时PCR检测靶向无翅型MMTV整合位点家族(WNT)通路5个关键基因[无翅型MMTV整合位点家族成员11(WNT11)、无翅型MMTV整合位点家族成员2B(WNT2B)、卷曲同源物2(FZD2)、低密度脂蛋白受体相关蛋白6(LRP6)、磷脂酶C-β4(PLCβ4)]表达.结果:与HD提取物、SB提取物相比,1、2、4mg/mL这3个浓度HD-SB提取物处理HT-29、SW620细胞后,活力显著下降(P<0.05).转录组测序发现,与对照组比较,HD-SB组1 522个差异基因发生显著变化(P<0.05),其中有203个基因表达显著上调(P<0.05),1 319个基因表达显著下调(P<0.05).GO富集分析显示,mRNA中的差异基因主要与细胞组分、细胞表达调控、免疫反应的调控等功能相关;KEGG分析显示,差异基因参与的通路主要有代谢相关信号通路、癌症相关通路、丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)信号通路、WNT信号通路等.与对照组比较,HD-SB组WNT通路的WNT11、WNT2B、FZD2、LRP6、PLCβ4 5个关键基因表达均显著下调(P<0.05).结论:HD-SB提取物可抑制结直肠癌SW620细胞增殖,其机制可能与抑制WNT通路活化有关.
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