换一批猪MHC-Ⅱ类区DQA新等位基因及新突变位点的发现
Characterization of Novel Alleles and New Mutation Sites of Porcine MHC Class Ⅱ DQA
摘要根据猪SLA-DQA基因cDNA序列和人HLA-DQA基因组序列设计引物,在猪中成功扩增了一个731 bp的片段,该片段包括猪SLA-DQA基因的大部分第2外显子、完整第2内含子和少部分第3外显子,通过克隆和PCR直接测序获得该片段的核苷酸序列.在家系中对第2外显子的核苷酸序列和其编码的α1结构域的氨基酸序列进行了分析,并与GenBank中所有的SLA-DQA第2外显子序列进行比较分析,发现有4个新突变位点和两个新等位基因存在.新等位基因分别是DQA-SLT 26和DQA-TC 21-1.DQA-SLT 26与单倍型c、d相比有8个核苷酸的差异和4个氨基酸的改变:单倍型c、d在60、65、81、93位的氨基酸分别是Val、Lys、Asp、Lys;而DQA-SLT 26相应的氨基酸是Ala、Glu、Gly、Ile.DQA-TC 21-1与单倍型c、d相比存在1个氨基酸的改变,由单倍型c和d中94位氨基酸His变为Tyr.
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分类号
S828.2
栏目名称
发布时间
2003-12-05（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
基金项目
国家重点基础研究发展计划（973计划）（G2000016103）
国家高技术研究发展计划（863计划）（2001AA222241,2001AA213061）
国家自然科学基金（39925027）
教育部科学技术研究项目（01121）
湖北省科技攻关计划（2002AA201C27）
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