应用基因芯片技术筛选人肺腺癌SPC-A1多西他赛耐药差异表达基因
Screening differential expression of docetaxel-resistance related genes of human lung adenocarcinoma cell line SPC-A1 by cDNA microarray
摘要背景与目的 多西他赛是近年来应用于临床的一种有效的化疗药物,其独特的作用机制使其具有良好的应用前景,然而耐药性影响其更广泛的应用.本研究的目的是应用基因芯片比较人肺腺癌多西他赛耐药细胞系SPC-A1/Docetaxel与其亲本株基因表达的差异,筛选与耐药相关的基因.方法 分别提取SPC-A1/Docetaxel与其亲本株SPC-A1的总RNA并纯化mRNA,将等量mRNA逆转录合成cDNA,在Affymetrix HC-U133A2.0基因芯片上杂交,扫描荧光信号图像,用Affymetrix GeneChip Operating Software Version 1.0软件进行数字化处理和分析,进一步采用RT-PCR验证部分差异表达基因.结果 SPC-A1/Docetaxel与SPC-A1差异表达基因一共有934条,其中上调428条,下调506条.差异表达的基因涉及ABC运载体、凋亡、微管蛋白、信号传导、酶等多方面.RT-RCR验证显示,SPC-A1/Docetaxel细胞ABCB1、ABCC4、ABCG2、BCL-2、TUBB2A、TUBB2C、TUBB3的表达明显高于SPC-A1,而SPC-A1/Docetaxel细胞BAX的表达明显低于SPC-A1.结论 这些差异表达的基因可能与人肺腺癌细胞的多西他赛耐药性相关.
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