基于铜死亡相关基因构建肺腺癌预后模型和药物敏感性分析
Construction of Lung Adenocarcinoma Prognosis Model and Drug Sensitivity Analysis Based on Cuproptosis Related Genes
摘要背景与目的 肺癌是全球最常见的恶性肿瘤之一,目前肺癌筛查和治疗策略不断完善,但其5年生存率仍然很低,严重危害人类的健康.因此探索新的生物标志物,提供个体化治疗并改善患者预后至关重要.铜死亡是一种新发现的细胞死亡类型,是由于细胞内过量铜离子积累,最终导致细胞死亡,已有研究提示其与肺腺癌(lung adenocarcinoma,LUAD)的发生发展密切相关.本研究基于肿瘤基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)数据库,探究铜死亡相关基因(cuproptosis related gene,CRGs)与LUAD预后之间的关联,建立预后风险模型并分析CRGs与LUAD免疫细胞浸润之间的相互作用,为肺腺癌患者的治疗及预后提供参考.方法 从TCGA数据库中下载LUAD组织和癌旁或正常肺组织的RNA-seq数据,从基因型-组织表达资料库(Genotype-tissue Expression,GTEx)下载正常肺组织的RNA-seq数据,并从基因表达综合数据库(Gene Expression Omnibus,GEO)下载462例肺腺癌数据作为验证,采用单因素Cox和Lasso-Cox回归分析构建评估预后的风险评分模型,用受试者工作特征(receiver operating characteristic,ROC)曲线及校准曲线评价模型的预测能力.并进一步对高、低风险组进行免疫相关和药物敏感性分析.结果 共得到1656个CRGs,其中有1356个存在差异表达的CRGs,基于单因素Cox和Lasso-Cox回归分析筛选出13个CRGs构建预后风险模型,ROC曲线1、3、5年的曲线下面积(area under the curve,AUC)分别为0.749、0.740、0.689.进一步研究高、低风险组之间免疫相关功能和免疫检查点差异分析.高风险组对萨沃替尼、帕博西尼、阿糖胞苷等药物敏感性更高,更容易从免疫治疗中获益.结论 基于13个CRGs构建的风险模型具有较好的预后价值,可以辅助LUAD患者进行个体化治疗,为LUAD的治疗及预后研究提供了重要理论依据.
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