换一批
换一批子痫前期易感基因HLA-G SNPs的生物信息学分析和筛选
Bioinformatics analysis and screening of SNPs of preeclampsia susceptible gene HLA-G
摘要目的:应用生物信息学的方法分析疾病相关基因单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,SNPs)位点,筛选可导致子痫前期易感基因HLA-G功能变化的SNPs位点.方法:使用SNPper软件从公共数据库dbSNP获得HLA-G编码区的SNPs数据,并下载SNPs位点侧翼序列,使用PARSESNP软件进行分析.结果:在HLA-G基因的编码区发现5个SNPs位点(C343T、C348T、A396T、A466G、C1903T),PSSM Difference分别为19.5、17.4、15.6、6.8和16,其单核苷酸的变化会引发错义突变,且PSSM Difference>10的突变很可能为有害突变.结论:本文应角生物信息学策略对子痫前期易感基因HLA-G编码区的SNPs进行分析,搜寻对HLA-G基因表达和蛋白质结构及功能产生影响的SNPs,为疾病与基因的关联性研究提供很有价值的信息.
更多相关知识
主题词
计算生物学(Computational Biology)基因(Genes)多态性, 单核苷酸(Polymorphism, Single Nucleotide)突变(Mutation)方法(Methods)
分类号
R714.24+5
发布时间
2011-04-07
基金项目
天津市卫生局科技基金资助
- 浏览260
- 被引1
- 下载0
相似文献
- 中文期刊
- 外文期刊
- 学位论文
- 会议论文
