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人子宫内膜细胞基因表达谱研究

Study on gene expression profile of human endometrial cells

摘要目的 通过研究人子宫内膜细胞基因表达谱,分析人子宫内膜特异表达基因的水平及相关信号通路.方法 通过新一代测序数字基因表达谱(DGE)方法对人子宫内膜细胞进行转录组测序,与人脐带间充质干细胞基因表达谱对比获得子宫内膜特异表达基因,进行GO注释富集分析和KEGG信号通路富集分析.结果 人子宫内膜细胞表达基因17 485个.其中与人脐带间充质干细胞基因表达谱对比,子宫内膜细胞特异表达基因3 651个.选取转录本定量FPKM值大于10个拷贝的627个子宫内膜特异表达基因,进行GO注释富集分析发现,子宫内膜特异表达基因与细胞外区域的结构和细胞外基质、胶原蛋白代谢、细胞迁移的调控等功能相关;KEGG信号通路富集分析发现,子宫内膜特异表达基因与黏着斑、吞噬泡、脂肪酸代谢、细胞凋亡等信号通路相关.结论 获取人原代子宫内膜细胞的基因表达谱,并对其差异基因进行GO注释和KEGG信号通路富集分析,可为进一步研究提高子宫内膜容受性的方法提供可靠依据.

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作者 芦小单 [1] 张强 [2] 魏丽杰 [3] 林秀英 [3] 付建华 [3] 王雪 [3] 刘磊 [3] 方艳秋 [1] 学术成果认领
作者单位 吉林省人民医院生殖医学中心,吉林长春130021;长春中医药大学医学院,吉林长春130021 [1] 吉林大学第二医院检验科,吉林长春,130022 [2] 吉林省人民医院生殖医学中心,吉林长春,130021 [3]
分类号 R335.5
栏目名称
DOI 10.7620/zgfybj.j.issn.1001-4411.2019.02.52
发布时间 2019-03-08
基金项目
吉林省科技厅项目(20180201028YY,20160414021GH); 吉林省卫健委项目(2016ZC016,2016Q007,2016J015,2017J022,2017J019)
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