换一批
换一批CADM-1对人宫颈癌Hela细胞转录组学的影响及意义
Effect and significance of CADM-1 on the transcriptome of human cervical cancer Hela cells
摘要目的 探讨粘附分子CADM-1基因对人类宫颈癌细胞系Hela细胞转录组学的影响.方法 构建rLV-hCADM-1-ZsGreen-Puro慢病毒和rLV-ZsGreen-Puro对照慢病毒,将感染rLV-h CADM-1-ZsGreen-Puro慢病毒的Hela细胞作为rLV-CADM-1组,将感染rLV-ZsGreen-Puro对照慢病毒的Hela细胞作为rLV组.筛选差异基因集并进行基因转录能力、基因本体(GO)功能、京都基因与基因组数据库(KEGG)信号通路、Reactome通路及疾病本体(DO)功能分析.结果 rLV-CADM-1组CADM-1相对表达量(38.57±2.58)显著高于rLV组(0.90±1.08),差异有统计学意义(t=20.460,P＜0.05).基因差异分析共筛选出321个差异表达的基因,其中表达上调171个、表达下调150个.差异最显著的前10个表达上调基因包括OLFM1、TUSC3、ENSG00000285779、SPARC、CCL5、ENSG00000261512、CADM-1、OAS1、CLIC3 及 CSAG3.差异最显著的前 10 个表达下调基因包括 COL16A1、SYTL4、ENSG00000278996、CGA、SLC47A1、TNC、ENSG00000276570、UGT3Al 及 MARCOL.功能分析结果显示,CADM-1改变了 Hela细胞部分基因的转录能力、参与调控GO功能、KEGG信号通路、Reactome通路及DO功能.结论 CADM-1可明显影响Hela细胞的转录组学.
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分类号
R711.74
栏目名称
DOI
10.19829/j.zgfybj.issn.1001-4411.2023.03.034
发布时间
2023-04-03
基金项目
湖南省自然科学基金项目（2021JJ70112）
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