应用16S rDNA测序分析肝、肾脓肿的病原菌特点

Characterization of pathogens in liver and renal abscesses by 16S rDNA sequencing

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摘要目的比较16S rDNA测序及传统培养在肝、肾脓肿病原菌检测中的价值,分析肝、肾脓肿病原菌特点和组成差异.方法收集2019年12月—2020年12月某院接受经皮穿刺引流治疗的32例患者(肝脓肿24例,肾脓肿8例)的脓肿引流液,采用传统培养和16S rDNA测序进行病原菌的鉴定,对比分析16S rDNA测序结果中肝、肾脓肿的菌群特点.结果脓肿引流液的传统培养结果为26例(81.25％)阳性,6例(18.75％)阴性(其中肝脓肿3例,肾脓肿3例),16S rDNA测序阳性率为100％.肝、肾脓肿组微生物菌群丰度相近,堆叠柱状图及主成分分析提示两组病原菌构成存在显著差异.线性判别式分析图提示肝脓肿组菌群以变形菌纲、肠杆菌目、肠杆菌科、克雷伯菌属为主要特征差异细菌菌类;肾脓肿组菌群以丛毛单胞菌科、分枝杆菌科、变形杆菌属、短芽孢杆菌属、解纤维素根瘤菌属、毛螺菌属、纤毛菌属、嗜糖假单胞菌属、分枝杆菌属、Thermicanus菌属,以及Saccharimonadaceae菌属为主要特征差异细菌菌类.结论 16S rDNA测序对于肝、肾脓肿的病原菌检测能力优于传统培养,肝、肾脓肿组病原菌组成存在差异,16S rDNA测序是深入了解肝、肾脓肿病原菌特点的有效方法.