换一批尘螨变应原Derf3、Derp3和Eurm3结构和功能的比较研究
Structure and func tion comparation of dust mite allergen Der f 3,Der p 3 and Eur m 3
摘要目的：比较尘螨变应原Der f 3、Der p 3和Eur m 3的结构及功能异同。方法：用ProtParam、PROSITE、Jpred、Modeller 9.12和ABCpred等生物信息学工具来预测、比较Der f 3、Der p 3和Eur m 3的一级、二级、三级结构及抗原表位。结果： Der f 3、Der p 3和Eur m 3氨基酸序列一致性为88.51％，都含有3个胰蛋白酶活性位点氨基酸及2个功能结构区特异性序列；二级和三级结构中都由α-螺旋、β-折叠和无规卷曲组成；活性位点氨基酸在三级结构中完全重合，并相互靠近构成蛋白酶的活性中心；主要潜在抗原表位区域都为5个，并在第79-81 aa、129-135 aa和172-174 aa区域出现了重合，但表位重合区的氨基酸种类不完全相同。结论：应用生物信息方法预测和比较了Der f 3、Der p 3和Eur m 3结构与抗原方面的信息，为进一步研究变应原功能、疫苗研制奠定了基础。
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分类号
Q71（生物大分子的结构和功能）
栏目名称
DOI
10.3969/j.issn.1000-484X.2014.10.002
发布时间
2014-11-13（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
基金项目
国家自然科学基金面上项目（(No.NSFC31272369)）
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