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牛丙型肝炎病毒核心蛋白结合蛋白6同源基因的克隆化研究

Cloning and sequence analysis of Bos taurus hepatitis C virus core-binding protein 6 (HCBP6) homologue gene

摘要:

目的利用不同种属动物之间重要基因序列高度同源的理论,应用生物信息学技术和方法,克隆牛丙型肝炎病毒(HCV)核心蛋白结合蛋白6(HCBP6)的同源基因.方法首先应用酵母双杂交技术,以表达HCV核心蛋白的表达载体为诱饵,对于百万级的肝细胞cDNA文库酵母进行配合、筛选,首先获得人HCBP6的全长编码基因,然后应用美国国立生物信息学中心(NCBI)建立的核苷酸序列数据库(GenBank)的同源基因的检索,搜索与之同源的来源于牛的表达序列标签(EST).然后根据基因同源性的原则,确定牛HCBP6的同源基因.结果获得了与HCV核心蛋白结合蛋白的36个基因片段,其中之一命名为HCBP6.根据基因同源性搜索,获得了来源于牛的EST基因序列片段,最终确立了牛HCBP6的同源基因.结论利用不同物种之间基因同源性的原理,NCBI数据库GenBank同源基因的搜索,获得了牛HCBP6同源基因.生物信息学技术在后基因组时代具有重要地位和作用.

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作者: 成军 [1] 李克 [1] 王琳 [1] 陆荫英 [1] 刘妍 [1] 王刚 [1] 张玲霞 [1]
期刊: 《中国人兽共患病杂志》2003年19卷5期 73-76页 ISTICPKUCSCD
分类号: R373.2
栏目名称: 实验研究
DOI: 10.3969/j.issn.1002-2694.2003.05.019
发布时间: 2004-02-20
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