换一批广州市2018年输入性登革病毒4型全基因组序列特征分析
Molecular characteristics of the full-length genomes of DENV-4 strains isolated from imported dengue fever cases in Guangzhou, China,2018
摘要目的 本文对广州市2018年输入性DENV-4型病毒的生物学来源进行分析,为本地登革热的防控提供科学依据并累积基线数据.方法 通过传染病监测网络收集广州市2018年输入性DENV-4病例,对急性期患者血清进行病毒分离培养并对分离到的DENV-4毒株进行全基因组测序、系统发生树重建和生物信息学分析.结果 共分离得到5株DENV-4毒株,其中4株由泰国和柬埔寨输入的分离株均属于DENV-4基因Ⅰ型;菲律宾输入的病例分离株与其他4株亲缘性较低,属于DENV-4基因Ⅱa型;5株分离株间的核苷酸(氨基酸)同源性为90.8％ (96.7％～96.9％);经过比对,5株分离株和6株参考株的E蛋白区域有9个位点出现差异,NS1蛋白区域有14个位点出现差异,NS5蛋白区域有25个位点出现差异.结论 本研究对广州地区输入性DENV-4毒株进行全基因组测定,间接地掌握周边国家地区DENV-4的基因特征,为本地登革热的防控和溯源提供基线数据,具有重要的公共卫生意义.
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栏目名称
DOI
10.3969/j.issn.1002-2694.2020.00.006
发布时间
2020-05-22（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
基金项目
广州市医学重点学科建设项目（(2017-2019-07)）
广州市科技计划项目（(201804020084)）
广州市卫生健康科技项目（(20191A011059)）
国家科技重大专项课题（(2017ZX1010-3011005)）
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